谈谈基因测序技术经历了哪几个发展阶段,这些技术的特点分别是什么 数据处理经历了哪些发展阶段,其特点分别是什么?

作者&投稿:兴霍 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
基因测序也称DNA测序,是现代生物学研究中重要的手段之一。基因测序技术经过了三个发展阶段。第一代DNA测序技术是1975年由桑格(Sanger)和考尔森(Coulson)提出的链终止法。第一代技术准确率高,读取长,是至今唯一可以进行“从头至尾”测序的方法,但存在成本高、速度慢等方面的不足,并不是最理想的测序方法。使用第一代Sanger测序技术完成的人类基因组计划,花费了30亿美元巨资,用了十三年的时间。
随后的二、三代测序技术以高通量为共同特征,也被称为“新一代测序技术(NGS)”。Roche公司的454测序平台、Illumina公司的Solexa测序系统以及ABI公司的SOLID测序系统标志着第二代测序技术诞生。尽管各系统在高通量水平、测序准确度、存储格式、技术方法上各有差异,但共同特征是大大降低了测序成本并极大地提高了测序速度,完成一个人的基因组测序只需一周左右时间。然而第二代测序技术在测序前要通过PCR段对待测片段进行扩增,增加了测序的错误率。而且二代测序产生的测序结果长度较短,需要对测序结果进行人工拼接,因此比较适合于对已知序列的基因组进行重新测序,而在对全新的基因组进行测序时还需要结合第一代测序技术。
近期出现的Helicos公司的Heliscope单分子测序仪、Pacific Biosciences公司的SMRT技术、Oxford Nanopore Technologies公司正在研究的纳米孔单分子技术,被认为是第三代测序技术。与前两代技术相比,其最大的特点是单分子测序。第三代测序技术解决了错误率的问题,通过增加荧光的信号强度及提高仪器的灵敏度等方法,使测序不再需要PCR扩增这个环节,实现了单分子测序并继承了高通量测序的优点。更多基因相关资讯可登陆盛景基因查看。

基因测序经历了哪些阶段?各自的特点是什么~

人工眼睛瞪的阶段(人眼检查荧光杂交信号)
96孔板(3730测序)
200bp * 1,000,000 reads ( 罗氏454 )
36bp * >10,000,100 reads (illumina GA)
全面进入illumina
(三代单分子测序)
10,000bp * 1,000,000(SMART PacBio)
未知(Oxford Nanopole)

数据处理先后经历了简单数据处理、文件系统、数据库系统三个发展阶段。
特点
1、在简单数据处理阶段,数据与程序没有分离,需要手工安装数据的存放方式和处理过程,仅用于简单数据计算的场合。
2、文件管理阶段有了专门的数据文件,数据采用统一方式组织,能够满足复杂数据处理的需要。
3、数据库系统阶段通过数据模型和数据库系统的组织,数据及其联系被统一考虑到数据库结构中,实现了全局数据库的统一,适合大型信息系统的应用要求。

扩展资料:
数据处理的过程大致分为数据的准备、处理和输出3个阶段。在数据准备阶段,将数据脱机输入到穿孔卡片、穿孔纸带、磁带或磁盘。这个阶段也可以称为数据的录入阶段。
数据录入以后,就要由计算机对数据进行处理,为此预先要由用户编制程序并把程序输入到计算机中,计算机是按程序的指示和要求对数据进行处理的。
所谓处理,就是指上述8个方面工作中的一个或若干个的组合。最后输出的是各种文字和数字的表格和报表。
数据处理系统已广泛地用于各种企业和事业,内容涉及薪金支付,票据收发、信贷和库存管理、生产调度、计划管理、销售分析等。它能产生操作报告、金融分析报告和统计报告等。数据处理技术涉及到文卷系统、数据库管理系统、分布式数据处理系统等方面的技术。
参考资料来源:百度百科-数据处理

大话cfDNA--起源篇
答:1989年,Stroun发现肿瘤患者血浆中增加的cfDNA与肿瘤组织DNA有相似的物理特征。 直到1996年,测序技术的发展,多组学者在不同的研究中才同时证明肿瘤患者中显著提高的cfDNA水平源自肿瘤组织。1999年,卢煜明运用PCR法扩增孕妇外周血浆中的Y染色体特异片段,证明怀有男胎的孕妇血浆中存在胎儿游离DNA。(卢神...

如何根据基因测序分析结果找通路
答:动植物基因组De novo测序分析也叫从头测序分析,指不依赖于任何参考序列信息就可对某动植物进行测序分析,使用最新的生物信息学方法进行序列拼接获得某物种的基因组序列图谱,并进行基因组结构注释、功能注释、比较基因组学分析等一系列的后续分析。三代测序技术(以PacBio和Nanopore为代表)具有读长长...

基因图谱的里程碑
答:科学家预计,在未来六年内个人基因组测序的成本将降至1000英镑。而对于普通大众而言,更为可喜的消息是,454生命科学公司的两个竞争对手CompleteGenomics公司及BioNanomatrix公司已宣布,将开发出成本为50英镑的个人基因组测序技术,这样的价钱仅相当于两条质量不错的牛仔裤,而时间却只需要几个小时。还有更...

简述基因工程基本过程
答:进行基因操作一般要经历四个基本步骤,也就是基因操作的“四步曲”。 提取目的基因 基因操作的第一步,是取得人们所需要的特定基因,也就是目的基因(如图)。如前 面提到的苏云金芽孢杆菌中的抗虫基因,还有植物的抗病(抗病毒、抗细菌)基因、 种子的贮藏蛋白的基因,以及人的胰岛素基因、干扰素基因等,都是目的基因。

未来几年DNA测序市场分析
答:短短几年时间,我国基因测序就经历了从无监管、到叫停、到试点申报、再到取消试点限制的一系列历程,可谓是政策发布最为频繁的行业之一。基因测序行业发展趋势 基因技术将被广泛应用于复杂疾病、农业基因组学、微生物学和宏基因组学等研究领域,将对人类健康、农业和环境保护带来巨大的变革;基因技术应用于...

物种越高等其基因组就越大两者成正比关系
答:3、单倍体检测法:通过收集物种体内的DNA样本,将其制备成单倍体样本,然后通过染色体分析、核酸杂交等方法,测定不同物种的基因组大小以及从中分离出特定的基因序列。4、基因测序技术:利用新一代测序技术,能够对物种基因组的整个序列进行测定,并对基因组的结构、进化发育等进行深入探究。5、确定物种的...

近些年来,为什么基因测试会成为一种热潮?
答:还有其他人也有和我类似的经历吗?”而之前的一项网络调查结果,就证实的确存在和斯科特类似经历的事情。在互联网上,斯科特加入了一个在线互助小组。这个小组是由基因咨询顾问布莱恩·柯克帕特里克(Brianne Kirkpatrick)成立的。柯克帕特里克主要专注于帮助通过自测基因测试而发现意外家庭秘密的人们。

研究进展 | 带你搭上单倍型基因组研究的快车
答:该研究清楚地表明现代栽培品种种内和种间基因渐渗对遗传多样性的贡献,为茶树的进化历史提供了遗传学和分子生物学方面的见解。同时,该研究表明,PacBio+Illumina+Hi-C测序技术可以助力准确单倍型基因组组装,为分析变异与驯化机制提供基因组资源。 一、研究背景 荔枝是重要的热带水果,在20多个国家都有种植,其突出的营...

应用蛋白组学或者基因组学的知识能做前瞻性研究吗?
答:图1所示的螺旋展示了遗传学和基因组学重要进展的里程碑,从孟德尔遗传法则的发现和其在20世纪初被重新发现[1]开始。DNA被确立是遗传的物质基础 [2]、DNA结构的确定[3]、遗传代码的阐明[4]、DNA重组技术的发展[5,6]、以及自动化程度日益提高的DNA测序技术的建立[7-10],为1990年启动人类基因组计划...

如何看待大数据基因的问题
答:21世纪初,人类基因组计划(HGP)发布了第一张人类基因草图,人的基因组约有30亿个碱基对,意味着每一个人的基因组有3Gb以上的数据。该计划曾与上世纪的曼哈顿计划(原子弹制造)、阿波罗登月计划并称为三大科学计划,为本世纪的一个里程碑式的科学工程。15年过去了,基因组测序技术发展之快已经超乎人们...