为什么有时候微小rna的靶基因,蛋白水平下调并不明显 microrna对靶基因的调控都是转录后水平吗 mrna

作者&投稿:陈施 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
  微小RNAs(microRNAs,miRNAs)是一类基因组编码、非蛋白质编码的小RNA,在转录后水平负性调节靶基因表达。本研究探讨miRNAs在自发性高血压大鼠(spontaneously
hypertensive
rats,SHR)主动脉的表达特征及其与高血压的关系。取4、8、16和24周龄雄性SHR大鼠及同龄正常血压对照(Wistar-Kyoto,WKY)大鼠。MiRanda、TargetScan和PicTar用于候选miRNAs及靶基因预测分析。通过实时定量RT-PCR检测大鼠主动脉miR-1、miR-133a、miR-155及miR-208的表达,并进一步通过实时定量RT-PCR检测呈差异表达的miR-155和miR-208的预测靶基因mRNA表达。结果显示,SHR大鼠主动脉miR-155表达在4、8、24周时与同龄WKY大鼠无显著差异,但在16周时明显低于同龄WKY大鼠(P0.05),且大鼠主动脉miR-155表达量与血压呈负相关(r=-0.525,P0.05)。MiR-208表达在4周龄时最高,随年龄增长明显下降(P0.05),其表达水平与血压和年龄呈负相关(r=-0.400,P0.05;r=-0.684,P0.0001),但在SHR和WKY大鼠之间无显著差异。miR-1和miR-133a在各年龄组SHR和WKY大鼠间未呈现差异表达。MiR-155和miR-208表达与相应预测靶基因mRNA表达无显著负相关性。以上结果表明,miR-155表达在成年SHR大鼠主动脉明显低于WKY,并与血压呈负相关,提示miR-155可能参与高血压的发生发展,主动脉miR-155表达异常可能是SHR大鼠血压升高的原因之一。大鼠主动脉miR-208表达在幼年时最高,随年龄增长而明显下降,提示其可能与血管发育有关。
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Wistar Kyoto(wKY)大鼠 模型是怎样建立的?~

是基因突变模型,不能自己造模,只能购买

miRNA对 [靶基因] 的调控确切的说在转录水平影响mRNA 从而影响靶蛋白的翻译水平,或其它下游被调控的蛋白。蛋白翻译水平的改变是miRNA调控的表现。

microrna干扰,与传统rnai相比有何优势
答:基因和microrna有多个结合位点 合生基因构建的miRNA sponge抑制载体,经特异地优化设计,增强吸附能力的同时增加了更多的结合位点,这样提高了成熟miRNA或siRNA抑制能力,消弱细胞中miRNA或siRNA导致的基因沉默效应,从而进行miRNA或siRNA功能缺失性研究。最近进行课题设计,想验证一下microRNA和预测的靶基因是否...

RIsearch2使用方法-预测RNA-RNA互作(sRNA的靶基因)
答:RIsearch2是RNA-RNA相互作用预测工具,可以在给定的query和target序列之间形成互补定位。使用基于suffix arrays的seed-and-extend框架,RIsearch2可以发现RNA-RNA相互作用关系,这种发现可以基于基因组或转录组。类似之前的 RIsearch ,RIsearch2也使用基于di-nucleotides to approximate nearest-neighbor energy ...

预测tsRNA下游靶基因数据库有哪些?
答:胞中发现。一个microRNA分子与其他分子RNA相比,核苷酸数较少(平均22)。miRNA作用是绑定到目标信使RNA转

什么是转录因子?什么是靶基因?两者关系是什么?
答:增强子,或者其他的调控区域。结合后要么是RNA聚合酶的结合增强,导致该基因的表达增多。要么妨碍RNA聚合酶的结合,阻碍该基因的表达。这些DNA结合蛋白一般都有2个功能区,一个管DNA结合, 一个管和其他蛋白质的相互作用。这个鞋蛋白质就是转录因子。而他们各自所控制的基因就是靶基因。

靶基因验证的方法一般有几种?双荧光素酶活性实验与westblot实验比较的...
答:这个SNP位点在种子区,推测也具有一定功能。第一步想克隆microRNA到表达载体,同时克隆3’-UTR区(包括野生型和突变型)到PGL-3 control 荧光素酶基因下游,双转细胞后,利用荧光素酶报告系统检测两者是否结合,snp位点是否影响结合。请问具体的实验设计:1.选取什么细胞系进行实验,是靶基因和miRNA内源...

什么是DNA什么是RNA
答:一般临床检测标本,可采用快速简便的方法溶解细胞,裂解病原体,消化除去染色体的蛋白质使靶基因游离,直接 用于PCR扩增。RNA模板提取一般采用异硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止RNase降解RNA。 Mg2+浓度 Mg2+对PCR扩增的特异性和产量有显著的影响,在一般的PCR反应中,各种dNTP浓度为200umol/L时,Mg2+浓度为1.5~2.0mmol/L为...

基因敲除,rna干扰,基因沉默有什么关系
答:基因敲除是指利用各种手段使某个基因不再表达,常见的方法是在基因的转录区插入一段外源DNA序列,从而破坏该基因的表达;RNA干扰是指一类小RNA可以与目的基因配对结合,从而使正常的基因表达受到干扰;基因沉默是指位于有些基因座的基因其表达不活跃甚至不表达的现象。

过表达敲低RNAseq找靶基因分析思路讨论
答:    确定表型有改变的,而下游分子可能性很多,不确定是哪一个,怎么找?先做个RNAseq看看吧,文献一般是这样做的,我们也认为这样是可行的。那么做RNAseq(全基因表达谱实验)到底能不能找到靶标。找靶标的分析思路是什么?    如何展现这个基因的...

siRNA跟miRNA有什么区别吗
答:二者都是被Dicer降解后,用于抑制靶mRNA转录、翻译或者能够剪切靶mRNA并促进其降解,即转录后水平的基因沉默。区别有以下2点:1、结合位点不同。miRNA的结合位点通常位于3`UTR,而siRNA的结合位点不确定。siRNA(21~25碱基),较少干扰RNA,在利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsRNA,或者转座子转录、...

miRNA agomir和miRNA agomir有什么区别?
答:二、结构不同:miRNA mimics与miRNA agomir结构上不相同。miRNA mimics为模拟生物体内源的miRNAs,运用化学合成的方法合成,能增强内源性miRNA的功能。miRNA agomir为经过特殊标记和化学修饰的双链小RNA,通过模拟内源性的miRNA来调节靶基因的生物学功能。三、功能不同:miRNA agomi与miRNA mimics使用方式不...